EP5:微流控帮助解析人肠道菌群的单细菌基因组千菌万码

EP5:微流控帮助解析人肠道菌群的单细菌基因组

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一支穿云箭,千菌万码来相见!大家好,我是张禅跑。

今天介绍的文章是:High-throughput, single-microbe genomics with strain resolution, applied to a human gut microbiome (高通量、有菌株解析度的单细菌基因组应用于人类肠道菌群);2022年6月发表于Science科学杂志上。

第一作者: 郑文山、赵诗杰

通讯作者:Peter Lu, Eric Alm, David Weitz

通讯单位:哈佛大学,麻省理工学院

00:55 研究菌群基因组的几种策略与其局限性

03:06 微流控技术Microfluidics简介

04:30 正文介绍,Microbe-Seq

08:03 Microbe-Seq的局限

08:54 利益相关声明

W. Zheng, S. Zhao, Y. Yin, H. Zhang, D. M. Needham, E. D. Evans, C. L. Dai, P. J. Lu, E. J. Alm, D. A. Weitz, High-throughput, single-microbe genomics with strain resolution, applied to a human gut microbiome. Science. 376 (2022), doi:10.1126/science.abm1483.

原文链接:www.science.org

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展开Show Notes
turtle1号
turtle1号
2022.6.29
这和single cell sequencing有什么差别
张禅跑
:
scRNA-seq测的是哺乳细胞转录组,是同一个基因组的不同转录组;这个测的是不同细菌的独立基因组。scRNA-seq通常也不是用微流控来做单细胞分选吧?