这篇文章详细介绍了一个名为 GYDE 的开源在线协作平台，旨在简化蛋白质设计与药物研发中的计算分析流程。该平台通过一个集成的可视化界面，将序列、结构与功能之间的复杂关系紧密结合，使不具备编程能力的实验科学家也能轻松使用先进的 AI 模型。GYDE 支持包括 AlphaFold 和 ProteinMPNN 在内的多种主流工具，能够执行结构预测、抗体工程和蛋白质优化等任务。通过模块化的系统架构和云端计算接口，研究人员可以高效地存储、分析并分享实验结果。文中的多个案例研究证明，该平台能显著提升跨学科团队在生物药开发过程中的协作效率与创新速度。

References:

• Down T, Warowny M, Walker A, et al. GYDE: A collaborative drug discovery platform for AI-powered protein design and engineering[J]. bioRxiv, 2026: 2026.03. 24.714039.