867-建立整体细胞状态与转换的简明框架

这篇论文提出了一种全方位细胞状态（holistic cell state）的全新理论框架，旨在整合大数据时代的多种观测维度。作者指出，传统的细胞定义已从形态学演变为基因组学，但单一的分子普查（如RNA测序）不足以完全揭示生命活动的复杂性。因此，该框架将细胞观测值归纳为分子组成、空间组织、细胞功能以及外部环境四个核心类别。通过弹簧连接的四面体这一视觉模型，文章生动地展示了这些类别之间如何通过双向反馈维持状态稳定或驱动状态转换。这种数据驱动的方法为建立定量且具有预测性的细胞生物学模型奠定了基础，力求在海量单细胞数据中发现深层规律。其最终目标是实现细胞研究的“开普勒化”，即从繁杂的观测中提炼出解析生命本质的通用原则。

References:

• Rafelski S M, Theriot J A. Establishing a conceptual framework for holistic cell states and state transitions[J]. Cell, 2024, 187(11): 2633-2651.