scBaseCount 是目前全球规模最大的公共单细胞基因表达数据库,总计收录了跨越 27 个物种与 75 种组织的逾 5.02 亿个细胞。该项目创新性地借助名为 SRAgent 的自主式人工智能代理,自动完成海量测序数据的发现、元数据提取以及标准化的注释工作。此外,数据库通过 scRecounter 管道进行了统一的重新处理,从而有效消除了传统数据整合中常见的技术偏差与批次效应。这一标准化处理不仅保障了跨研究间分析的可靠性,还为训练先进的细胞状态 AI 模型 提供了高质量、多样化的丰富训练集。最终,该研究不仅构建了一个强大的生物信息学共享资源,也为未来大规模生物医学数据集的自动化策划树立了全新范例。
References:
Youngblut N D, Carpenter C, Nayebnazar A, et al. scBaseCount: An AI agent-curated, standardized, auto-updated single-cell data repository[J]. Cell, 2026, 189(19): 5932-5944. e6.

