1757-基于空间转录组学的人类组织多尺度建模与表征聊聊Sci

1757-基于空间转录组学的人类组织多尺度建模与表征

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TERRA是一个基于多尺度空间转录组的自监督基础模型,它利用包含1.12亿个人类细胞的庞大数据集进行预训练,能够在无需特定任务微调的情况下实现零样本泛化。该模型通过创新的空间标记化方案,在单细胞分辨率下同时捕捉基因、细胞以及局部微环境三个嵌套尺度的表征,并能有效模拟基因敲除等计算机模拟扰动。在实际应用中,TERRA成功绘制了人类胚胎胰腺的发育轨迹、预测了肾脏中免疫检查点阻断疗法引起的损伤特征,并系统揭示了跨组织巨噬细胞的空间原型。总体而言,该模型突破了传统方法局限于特定数据集的局限,为组织生物学研究和临床应用提供了一个强大且可迁移的通用计算框架。

References:

  • Birk S, Sanian M V, Vahidi A, et al. Multi-scale modeling of human tissues from spatial transcriptomics with TERRA[J]. BioRxiv, 2026: 2026.07. 29.741565.