1758-构建优化单细胞参考图谱的 scAtlasTb 工具包聊聊Sci

1758-构建优化单细胞参考图谱的 scAtlasTb 工具包

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本文介绍了 scAtlasTb(单细胞图谱工具箱),这是一个旨在支持人类细胞图谱大规模构建的模块化开源框架。该工具箱通过结合数据预处理、量化评估、可扩展基准测试以及可视化功能,解决了构建高质量参考图谱时过程不一、标准不统一的难题。研究人员利用该框架对肺部、视网膜和外周血单核细胞(PBMC)等大型数据集进行了案例研究,系统优化了质量控制、批次效应校正、特征选择以及数据整合策略。最终,scAtlasTb 将图谱构建过程转变为一个证据驱动且可重复的优化流程,显著提升了单细胞基因组学数据分析的准确性与生物学洞察力。

References:

  • Mueller M F, Cujba A M, Romanovskaia D, et al. Building optimized single-cell reference atlases with scAtlasTb[J]. bioRxiv, 2026: 2026.07. 30.741695.