从神经外科到计算建模，从实验小鼠到脑计划蓝图——本期我们与两位计算神经科学探索者深入探讨智能的本质、人脑与AI的根本差异，以及这个神秘领域如何在数据洪流与理论困境中前行。无论你是对意识好奇的哲学爱好者，还是关注AI极限的科技观察者，这场对话都将带你触及智能科学的深邃边界。 🎙️ 本期嘉宾： * 曹老师：日本某脑科学研究所研究员，计算神经科学博士生。研究方向：元认知、感知的计算建模 * 阿苏：美国高校脑启发人工智能（Brain-inspired AI）方向博士生。研究方向：基于神经科学原理设计AI算法。 * 主持人：小羊，小泽 时间轴： 01:19 – 嘉宾背景：从神经外科到计算神经科学 07:23 – 计算神经科学是什么？ 用代码和数学模型研究大脑，基于fMRI、单细胞记录等数据；与实验神经生物学的关系。 11:49 – 理解大脑 = 重建智能吗？ 14:53 – 我们该如何定义智能？ 细菌、线虫、狗——智能的边界在哪里？资源限制原来对于智能的产生如此重要 22:24 – LLM与人脑可比吗？“语言”的地位为何如此特殊？ 25:58 – AI有“主观能动性”吗？ AI缺乏生存压力与资源限制，其“进化”是人类设计的优化； 33:08 – 具身性：AI需要身体吗？ 40:49 – 计算神经科学简史 50:11 – 全球脑计划面面观：美国，欧盟，日本，中国的不同视角。 56:30 – 结尾：神经科学如何改变我们看世界的方式？到底人类智能和AI智能有什么本质差异？ “人类最宝贵的部分，可能是我们非理性的部分。” 🧠 关键概念： * 计算神经科学：用数学与计算模型研究大脑工作机制 * Qualia（感受质）：主观体验（如颜色、痛感）的内在感受 * 具身性：智能需通过身体与外界交互获得体验 * 预测编码：大脑通过自上而下预测与自下而上误差修正处理信息 🔗 相关提及 * 书籍：《Theoretical Neuroscience》（理论神经科学经典教材） * 理论：整合信息论（IIT）、预测编码、贝叶斯脑假说 * 机构：美国BRAIN计划、欧盟Human Brain Project、日本Brain/MINDS、中国脑计划 关于我们: 小羊 - 生物科技公司生信岗打工人，专注于肿瘤精准医疗。什么都想学一学，想要成为生活杂家，攀岩烘焙修炼中。 Alex - 计算机生物PhD在读，梦想成为生命探险家，过有趣的一生。 小泽 - 非典型生物物理学博士生，从力学跳槽到生物领域，身体力行成为了无知者无畏的真实写照😅，目前专注单细胞测序技术开发。

2025 年的最后一期节目，我们想慢下来，聊点更走心的东西。这一期的灵感来自我们很喜欢的播客《没理想编辑部》——我们从一份10个问题的清单出发，开启了一场年底的坦白局。 这期节目我们也邀请到了斯坦福在读PhD小篱，同时她也是播客《X的多重宇宙》的主播之一，一起加入这场关于回顾、困惑与成长的对话。 这一期不只是我们的复盘，也邀请正在听这期节目的你，一起参与进来：如果你也想在年末认真回望这一年，却不知道从哪里开始，不妨拿走这 10 个问题，和我们一起，把 2025 再走一遍。 02:08 今年捅过的一个篓子 08:12 在哪方面我是专业的 14:16 最有挑战性的一件事 29:10 最有趣的事 31:05 最绝望的时候 35:47 最恍然大悟的事 39:18 最令人难忘的评价 41:07 今年的一个奇遇 44:12 思考最久的一个问题 47:19 明年希望探索和践行的事 49:35 八爪鱼bioctopus播客明年的愿景 我们聊到的内容： 小篱加入的创业组织 — 华源HYSTA，总部位于硅谷的非营利组织，致力于服务华裔专业人士与创业者，重点关注科学与技术领域的领导力、创业与职业发展。 小泽参加的跑山活动 — 斯巴达勇士赛（Spartan Race），将越野跑、障碍挑战与斯巴达勇士的坚韧精神结合，是一项全球性的极限健身和障碍跑活动。 小篱提到的利他性相关书籍 — 《人性的弱点》 Alex的人生艺术家 — Georgia O'keeffe，美国现代主义艺术的重要代表人物，以大胆的色彩、简洁而富有力量的形式著称，尤其以花卉、动物骨骼与新墨西哥风景闻名。 小泽的花栗鼠 Alex和小羊看的音乐剧 — 《Suffs》，是一部讲述美国女性争取选举权运动的百老汇音乐剧它以真实历史人物为核心，聚焦不同女性在理念、策略与代际之间的分歧与合作，呈现了一段关于权利、坚持与改变的群像故事。 片尾曲：《Keep Marching》from Suffs

本期节目，我们邀请到硅谷AI生物科技新锐公司EvolutionaryScale的机器学习工程师Tina，一起深入探讨蛋白质生成式AI模型ESM3如何颠覆传统生物研究。从Meta实验室被裁到组建初创公司，再到加入扎克伯格生物中心，这支团队如何用“科技公司思维”破解蛋白质设计难题？我们还将讨论AI制药的现状、模型可解释性的挑战，以及硅谷工程师如何用“初学者心态”推动基础科学。 本期嘉宾: Tina｜Evolutionary Scale机器学习工程师，前自动驾驶领域产品经理，从零转型AI生物领域的跨行者 时间轴： 06:10 AI制药行业光谱：传统药厂 vs. 科技巨头 08:00 为什么AI特别适合解决生物问题？ 12:39 “失败经验限制想象力”：科技公司背景团队的“初学者心态”优势 17:48 蛋白质结构预测的演进史 23:43 Scaling Law的坚定信仰: 为何相信“数据+算力”优于复杂模型架构？ 27:07 最浪漫的评估指标：生成具有发光功能的GFP蛋白质，模拟自然界5亿年演化 32:32 AI制药的现实挑战：结构预测的“失之毫厘，谬以千里”、毒性、特异性等临床前障碍 相关提及: * 公司：Evolutionary Scale, Meta FAIR, Google Health, OpenAI, Chan Zuckerberg Biohub * 文章：《The Bitter Lesson》 我们的小红书账号也开始运营啦！如果不想要错过我们的内容更新，欢迎大家关注我们的小红书账号 @八爪鱼bioctopus🐙 感谢收听！欢迎订阅、转发给身边感兴趣的朋友们！ 关于我们: 小羊 - 生物科技公司生信岗打工人，专注于肿瘤精准医疗。什么都想学一学，想要成为生活杂家，攀岩烘焙修炼中。 Alex - 计算机生物PhD在读，梦想成为生命探险家，过有趣的一生。 小泽 - 非典型生物物理学博士生，从力学跳槽到生物领域，身体力行成为了无知者无畏的真实写照😅，目前专注单细胞测序技术开发。

本期节目，我们对话位于硅谷的初创公司Kepler AI的两位联合创始人Ashton与Quinn，深入探讨AI Agent如何解决生物信息学中的"最后一公里"难题，科学家与AI的合作新模式，以及从大厂到创业的心路历程。 Kepler AI是一家位于硅谷的初创公司，专注于开发企业级别的生物信息AI Agents，加速科学发现。 时间轴： 02:15 - 为什么生物信息学需要AI Agent？ 生物信息学领域知识碎片化，湿实验专家、数据分析师和软件工程师之间存在巨大沟通壁垒。LLM技术在工具调用和自然语言交互上的突破赋能各个职位。 08:30 - Kepler的应用场景 湿实验科学家现在无需编写代码就能分析自有数据，生物信息学家可以大幅加速项目迭代过程。AI Agent正在处理那些曾经因为时间和技术限制而被忽略的80%数据。 14:22 - 药厂的"最后一公里"难题 在生物医药，客户愿意为提升最后那5%的准确度，而支付5倍甚至100倍的价格。Kepler通过接入专业数据库和提供结构化输出，解决了通用大模型在生物医药专业领域"最后一公里"的问题。 19:45 - AI Scientist的未来展望 当前的AI Scientist更多是单点解决方案，专注于实验设计、文献查询等具体任务。未来将向端到端串联发展，但复杂的人机沟通仍然是实现真正AI Scientist的主要挑战。 27:44 - 全职创业的心路历程 Ashton和Quinn分享自己全职创业的心路历程、发展规划和底层动力。 35:44 - 创业者的日常与成长 创业的典型一天是怎么样的？怎么选择你的团队？如何定义成功与失败？身处硅谷，如何在这样一个信息爆炸的环境中自处？听创始人分享自己的思考和感悟。 我们的小红书账号也开始运营啦！如果不想要错过我们的内容更新，欢迎大家关注我们的小红书账号 @八爪鱼bioctopus🐙 感谢收听！欢迎订阅、转发给身边感兴趣的朋友们！ 关于我们: 小羊 - 生物科技公司生信岗打工人，专注于肿瘤精准医疗。什么都想学一学，想要成为生活杂家，攀岩烘焙修炼中。 Alex - 计算机生物PhD在读，梦想成为生命探险家，过有趣的一生。 小泽 - 非典型生物物理学博士生，从力学跳槽到生物领域，身体力行成为了无知者无畏的真实写照😅，目前专注单细胞测序技术开发。

本期节目深入探讨生物医药领域最火热的前沿技术：类器官。我们邀请到了国内类器官公司的一线研发者，揭秘类器官如何替代动物实验、加速抗癌药筛选、甚至未来实现“器官定制”。从肝脏毒性测试到皮肤芯片国家标准，从肿瘤精准医疗到全脑类器官的伦理争议，带你看懂类器官的现在与未来。 时间轴 00:00 – 开场：辉瑞减肥药翻车，为什么动物实验救不了新药？ * FDA推进类器官替代动物实验：为什么动物模型不靠谱？ 03:11 – 类器官是什么？从海绵（是一种动物！）自组织到iPSC干细胞革命 * 请看文尾图：） 07:10 – 类器官 vs 器官芯片：城市 vs 高速公路系统 * 类器官是三维细胞团，器官芯片为其提供微流体“营养公路” 09:46 – 类器官实战应用 * 肝脏毒性检测：一颗类器官100元，提前筛出60%漏检毒物 * 皮肤芯片：国内首个国家标准，替代兔子滴眼实验，欧莱雅早期探索 * 肿瘤替身：患者活检样本2–3周试多药，加速精准治疗 * 全脑类器官：40天胎儿脑模型引发“意识风险”伦理讨论 * 再生医学：全球首例唾液腺移植成功，未来或替代肝肾移植 36:12 – 行业现状 * 国内上下游80+公司参与展会，但重要外支架Matrigel仍被美国CORNING垄断 * 政府基金入场，痛点：标准化缺失、患者认知不足 45:54 – 自动化设备：液滴工程如何实现高通量生产？ 51:39 – 主讲人的小红书使命：让更多人知道类器官的存在 * “患者不知道类器官，才是最大阻碍！” 52:11 – 结尾重磅新闻：NIH成立类器官标准化中心 * 美国国立卫生研究院设立SOM Center，推动类器官替代动物实验 （小编偷偷放的网图 嘘🤫 关于我们： 小羊 - 生物科技公司生信岗打工人，专注于肿瘤精准医疗。什么都想学一学，想要成为生活杂家，攀岩烘焙修炼中。 Alex - 计算机生物PhD在读，梦想成为生命探险家，过有趣的一生。 小泽 - 非典型生物物理学博士生，从力学跳槽到生物领域，身体力行成为了无知者无畏的真实写照😅，目前专注单细胞测序技术开发。

本期节目是生物医药咨询主题的下半场，我们继续与神经生物学PhD、咨询顾问Susie深度对话。揭秘咨询公司到底是如何在药企背后运筹帷幄，并解析全球医药市场的最新趋势。 八爪鱼温馨提醒：本期为咨询主题下半场，如果感兴趣转型经验+行业入门，建议收听EP6.1。 时间轴： 00:00 – 开场介绍 本期聚焦四大板块：市场准入、战略咨询、全球拓展、商业优化。 02:10 – 市场准入：药价怎么定？保险公司凭什么说了算？ 访谈医疗保险和资深医生、建立定价模型，药企定价背后的逻辑大揭秘。 13:25 – 战略咨询：10 年后的阿尔茨海默市场要怎么玩？ 以阿兹海默为例，讲述从 patient journey 到文献综述，咨询公司如何帮助药企预测未来市场格局。 24:40 – 全球化挑战：医保、政策、流行病学差异下的市场进入难题。 32:50 – 商业战略优化：药效好不够，还要能卖得动 专利期、竞争格局、定价博弈，咨询顾问如何帮药物商业成功。 42:00 – 近几年的行业趋势探究，为什么大药企都在缩减科研开支？ 关于我们: 小羊 - 生物科技公司生信岗打工人，专注于肿瘤精准医疗。什么都想学一学，想要成为生活杂家，攀岩烘焙修炼中。 Alex - 计算机生物PhD在读，梦想成为生命探险家，过有趣的一生。 小泽 - 非典型生物物理学博士生，从力学跳槽到生物领域，身体力行成为了无知者无畏的真实写照😅，目前专注单细胞测序技术开发。

本次节目八爪鱼邀请到了在北美精品生物医药咨询公司工作的Susie博士，聊了聊我们一直好奇的生物医药咨询行业。节目分为上下两期，本期聚焦PhD转型咨询的经验分享，下一期节目将会给大家带来更多生物医药咨询的行业洞见。 时间轴： 00:00 – 开场介绍 嘉宾Susie：神经生物学PhD转型咨询，现就职于北美精品生物医药咨询公司。 02:35 – 咨询公司的“魔幻”案例：从纽约垃圾桶到苹果供应链 纽约市政府花200万请麦肯锡设计新垃圾桶为何被骂？苹果的废料回收和阿联酋国民银行的AI转型又如何在咨询公司的帮助下如虎添翼？ 20:55 – Susie的转型故事：从实验室老鼠到商业战场 PhD中期觉醒之路：如何逃离5个月才能验证一个假设的神经生物学研究？ 29:00 – 生物医药咨询面试通关秘籍 Case interview刷题准备面试；快速学习能力成为咨询人必备技能。 33:42 – 咨询顾问的日常：每天写PPT？干到最后变销售？ 39:12 – 咨询是终点吗？Susie对未来的的职业规划。 关于我们: 小羊 - 生物科技公司生信岗打工人，专注于肿瘤精准医疗。什么都想学一学，想要成为生活杂家，攀岩烘焙修炼中。 Alex - 计算机生物PhD在读，梦想成为生命探险家，过有趣的一生。 小泽 - 非典型生物物理学博士生，从力学跳槽到生物领域，身体力行成为了无知者无畏的真实写照😅，目前专注单细胞测序技术开发。

本期节目是八爪鱼的一次全新尝试：我们希望以明星公司为切入点，聊聊背后的行业趋势与发展。这一期，我们聚焦近期热度颇高的 Tempus AI，以及它所代表的精准医疗赛道。欢迎收听！ 02:28 – Tempus AI在资本市场浮浮沉沉：佩洛西抛售英伟达、苹果，重仓Tempus AI；做空机构严重指控；Tempus AI为何是市场焦点 03:48 – 精准医疗的本质突破：从“千人一方”到基因定制疗法，如何通过基因组测序、电子病历和生活方式数据实现个性化治疗？ 16:05 – 创始人Eric的争议人生：“被女友甩后卖地毯年入十几万"——Groupon黑历史与癌症数据帝国的诞生。 22:10 – 创业契机：妻子患癌暴露的行业痛点，“医生治疗没有数据支持，因为没有完整数据库”，Tempus如何从绝望中诞生？ 25:40 – Tempus AI领跑的核心：医生下单到获取报告的完整流程解析。 27:55 – 盈利模式的争议：数据授权给药厂年收千万美元，AI只是噱头？ 32:32 – 做空报告实锤Tempus AI？ 患者年龄标记错误、样本记录矛盾，前员工爆料“不在乎科学”。 37:33 – AI医疗火热，Tempus AI为何领跑？ 关于我们: 小羊 - 生物科技公司生信岗打工人，专注于肿瘤精准医疗。什么都想学一学，想要成为生活杂家，攀岩烘焙修炼中。 Alex - 计算机生物PhD在读，梦想成为生命探险家，过有趣的一生。 小泽 - 非典型生物物理学博士生，从力学跳槽到生物领域，身体力行成为了无知者无畏的真实写照😅，目前专注单细胞测序技术开发。

在这期节目中，我们邀请到刚刚从美国医学院毕业的Nina，分享她成为医生的心路历程。从希波克拉底誓言的仪式感，到AI在医疗中的应用，再到不同科室的收入差异和职业选择，Nina用真实的故事和深刻的思考，带我们走进医学生的世界。 时间轴： 00:00 – 本期嘉宾Nina是刚从美国医学院毕业的新晋医生，即将开始内科住院医培训 “签工作合同时，感觉像签了卖身契——人生的一部分已经属于医学。” 03:36 – 美国医学院的4+4培养体系 四年本科+四年医学院的学制和申请医学院的隐形门槛，USMLE（美国医师执照考试）与专科选择。 11:30 – 面对生离死别：医生的情感挑战 “病人永远是医生最好的老师，他们活在我的心里。” 13:42 – AI在医疗中的应用 AI书写员、OpenEvidence，AI融入医生生活的机遇与挑战。 26:13 – 科室收入差异与职业选择，以及中美医疗体系的差异 37:56 – 学医的代价与坚持 “1/3的美国医生至少被告过一次。” 42:37 – 结尾：对医学的敬畏与热爱 “不要神化医生，职业和做人是两码事。脚踏实地，仰望星空。” 关于我们: 小羊 - 生物科技公司生信岗打工人，专注于肿瘤精准医疗。什么都想学一学，想要成为生活杂家，攀岩烘焙修炼中。 Alex - 计算机生物PhD在读，梦想成为生命探险家，过有趣的一生。 小泽 - 非典型生物物理学博士生，从力学跳槽到生物领域，身体力行成为了无知者无畏的真实写照😅，目前专注单细胞测序技术开发。

五一劳动节特辑来啦！在这期节目里八爪鱼和你一起深度探讨「向上管理」的生存智慧。从实验室到职场，从讨薪特种兵到导师安抚大师，聊聊那些我们与老板相处的实用经验。 时间轴： 01:10 - 选组如嫁人：决定未来5年幸福的关键选择 05:33 - 小泽谈好老板的黄金标准：有钱+给试错空间 09:01 - 微观管理（Micromanagement）的窒息体验 每两小时Slack查岗？Alex被质问"为什么没抄送我"？ 13:53 - 老板的格局决定牛马的破局 19:20 - 人文关怀重要吗？破洞牛仔裤引发的实验室温情回忆 27:21 - 讨薪大作战 小羊历经大半年拉锯战最终涨薪成功的血泪史。 35:37 - 老板预期管理：为什么总说"下周就能好"是灾难？ 42:48 - 会议纪要救大命："青天大老爷，这是你昨天让我做的！" 关于我们： 小羊 - 生物科技公司生信岗打工人，专注于肿瘤精准医疗。什么都想学一学，想要成为生活杂家，攀岩烘焙修炼中。 Alex - 计算机生物PhD在读，梦想成为生命探险家，过有趣的一生。 小泽 - 非典型生物物理学博士生，从力学跳槽到生物，身体力行成为了无知者无畏的真实写照😅，目前专注单细胞测序相关技术开发。

2025年2月20日，罗氏发布了全新测序技术SBX（Sequencing by Expansion），引发业界关注。SBX发布会上宣传的测序准确性达到Q39令人震惊，但这究竟是技术革命还是虚张声势？本期节目中，新主播小泽和小羊将带你深入解析SBX测序技术的核心创新、亮点和潜在局限，探讨其在学界和业界的应用前景。 时间轴： 00:00 – SBX测序技术来了！ 小羊和新主播小泽带你聚焦罗氏SBX测序技术！ 03:12 – 罗氏的测序执念：一路的收购与尝试 从454测序技术到最新的SBX技术，罗氏十几年在测序领域屡次尝试与挣扎背后的故事。 05:06 – 纳米孔技术 vs. Illumina：测序到底怎么测？ 详细解读纳米孔测序与illlumina测序技术的根本区别，以及Roche副总裁“我们高效测序DNA的办法是不测序DNA”的神秘含义。 07:09 – 什么是Xpandomer？罗氏的技术秘密武器 深度剖析SBX的核心Xpandomer技术如何实现信号增强，让测序更清晰、更高效。 08:45 - SBX是纳米孔测序，但是为什么测不长？ 作为纳米孔测序的SBX，为什么最终的测序长度止步在一两千？ 10:25 – SBX的技术优势在哪里？ 从“flexible operation”，到惊人的高通量和高准确度，小泽为你深度解读SBX的多维优势。 21:21 – SBX听起来很厉害，但它有哪些局限？ 新技术固然诱人，但价格未知加上技术的潜在局限，让想上桌吃饭的SBX面临挑战。 27:49 – 学术界和工业界，谁更适合SBX？ SBX能否真正挑战Illumina的江湖地位？小泽和小羊从各自领域的角度展开探讨。 33:36 – 总结与展望：SBX的未来值得期待吗？ SBX带来了短读长测序的新方案，尽管前景光明，但最终影响力还得看价格。 参考资料： * Roche的SBX测序发布的Webinar Recording：https://sequencing.roche.com/us/en/videos/webinar-sequencing-by-expansion-technology.html * X-NTP以及Xpandomer的结构： * 纳米孔读Xpandomer得到的清晰到肉眼可做basecalling的电信号（so crazyyyyyy。。。）： * 大家一起来学习一下大佬名言： "Our approach to efficiently sequencing DNA is to not sequence DNA." -- Mark Kokoris, Vice President, Head of SBX Technology at Roche Diagnostics Seattle. 关于我们： 小羊 - 生物科技公司生信岗打工人，专注于肿瘤精准医疗。什么都想学一学，想要成为生活杂家，攀岩烘焙修炼中。 Alex - 计算机生物PhD在读，梦想成为生命探险家，过有趣的一生。 小泽 - 非典型生物物理学博士生，从力学跳槽到生物，身体力行成为了无知者无畏的真实写照😅，目前专注单细胞测序相关技术开发。

八爪鱼bioctopus第一期节目来啦！在这里我们聚焦生物科技、医疗、AI的前沿动态，也分享个人成长的思考与实践。 去年，Alex做了一个让人惊讶的决定：她从美国某药厂R&D部门的生信组辞职，选择回到学术界读博，目前是Berkeley的PhD Student👩‍🔬。在这期节目里，Alex分享了她的心路历程。 时间轴： 00:00 – 我们是谁？ Alex和小羊开场打招呼，从生物科技到AI，从成长故事到行业八卦，咱们啥都聊！ 01:15 – 你疯了吧？！辞掉高薪工作去读博？ 小羊听说Alex要辞职去读博时，一脸震惊：“你之前的工作不是很不错吗？”Alex讲述自己的纠结——是继续稳定工作，还是追求更深层次的科研？ 02:49 – 读博到底是信仰，还是现实考量？ Alex回忆自己大学时的“跟风”心理，聊聊当初为什么没有立刻选择读博，而是先工作了几年再回到学术圈。 06:48 – 学界 vs. 业界：科研的意义感从哪里来？ 是在学术圈深耕研究、突破未知？还是在业界把技术落地，真正改变患者的生活？Alex和小羊有着不同的答案。 09:14 – 业界到底可以培养人吗？ Alex读博的终极目标是成为独立的科研者、影响行业的决策者；那么业界能否给她带来这样的成长呢？ 12:10 – 没有 PhD，在业界会被轻视吗？ 讨论职场里“学历鄙视链”的现实情况。没有博士学位，真的意味着升职更慢、话语权更少吗？ 17:14 – 为什么我没有选择读博？小羊的思考 既然行业里PhD偏多，为什么小羊没走这条路？ 21:49 – “小决定睁眼做，大决定闭眼做” 这句研讨会上听来的话，彻底点醒了 Alex，也帮她下定了决心——有些事情，分析再多都没用，去做了才知道值得不值得。 关于我们： 小羊 - 生物科技公司生信岗打工人，专注于肿瘤精准医疗。什么都想学一学，想要成为生活杂家，攀岩烘焙修炼中。 Alex - 计算机生物PhD在读，梦想成为生命探险家，过有趣的一生。 小泽 - 非典型生物物理学博士生，从力学跳槽到生物领域，身体力行成为了无知者无畏的真实写照，目前专注于单细胞测序技术开发。